主計室係負責辦理本校歲計、會計及統計等事務，分四組辦理，各組業務如下：

• 第一組：年度預算分配及各單位部門經費、場地收支、代收款、建教合作管理費及結餘款、投資收益及永續基金等經費審核。
• 第二組：年度預算籌編及收支估計表之編製及政府機關補助、推廣教育、權利金、捐款及雜項收入等收支併列業務之經費審核。
• 第三組：建教合作(國科會補助專題研究計畫、政府、業界及法人產學合作委辦計畫)、建教合作業界管理費等經費審核及半導體研究學院預算、收支估計表之編製、各類經費審核。
• 第四組：傳票編製、帳務處理、每月會計報告、半年結算報告、年度決算編製、外部單位(審計部、教育部等)審核通知事項之彙整辦理等。